Године 1991., ангажовањем тадашњег начелника одељења, др Љубомира Стојанова, започиње рад Генетичког саветовалишта. Циљ рада саветовалишта је да се породицама са ризиком за рађање детета са наследном болести пружи информација и, према потреби, организује пренатална дијагностика. У раду генетичког саветовалишта учествују добро обучени стручњаци из области педијатрије, гинекологије и молекуларне генетике.

Породице треба да се обрате за помоћ Генетичком саветовалишту у следећим ситуацијама: труднице са 35 или више година, патолошки резултати скрининга у трудноћи, дете са хромозомском аберацијом, два и више спонтаних побачаја, нејасна наследна болест у породици или сумња на наследну болест, дете са урођеном аномалијом, моногенска болест у породици (цистична фиброза, Дишенова мишићна дистрофија, спинална мишићна атрофија, урођене болести метаболизма, генетски синдроми...), дејство радијације, лекова, токсина или инфекције током трудноће.