Odlukom Ministarstva zdravlja Srbije iz 1993. i 1995. godine, Institut postaje nacionalna referentna ustanova za zdravstvenu zaštitu žena generativnog doba, predškolskoj i školskoj deci.
Na svojim odeljenjima i klinikama, Institut obavlja i razvija četiri osnovne delatnosti:

- Pružanje tercijarne zdravstvene zaštite deci predškolskog i školskog uzrasta i ženama generativnog doba

- Institut je nastavna baza Medicinskog fakulteta u Beogradu za dodiplomsko i poslediplomsko obrazovanje medicinskih radnika (studenata medicine, lekara opšte prakse, pedijatara, dečjih hirurga, ginekologa, anesteziologa, medicinskih sestara, babica itd.)

- Zakonodavna i metodološka delatnosti kroz tesnu saradnju sa Ministarstvom zdravlja, Institutom za zaštitu zdravlja Srbije, kao i primenom savremenih doktrina i smernica u institucijama i ustanovama primarne i sekundarne zdravstvene zaštite majke i deteta

- Izvođenje kliničkih istraživanja, epidemioloških studija i izdavačka delatnost u oblasti osnovnih delatnosti razvijanja nacionalne mreže zdravstvenih institucija namenjenih ženama generativnog doba, predškolskoj i školskoj deci.